domingo, 11 de marzo de 2012

Gen OCA 2

GEN OCA2
Títulos alternativos; símbolos ​​DILUCIÓN OJOS ROSADOS; PED
Localización del gen OCA2

GEN P
Aprobado HGNC símbolo de genes: OCA2
Citogenético ubicación: 15q12-q13     coordenadas Genómicas (GRCh37): 15:28,000,020 - 28344457 (de NCBI)
Las relaciones de genes Fenotipo
Ubicación Fenotipo Fenotipo
número MIM
15q12-q13 El albinismo, marrón oculocutáneo 203200
El albinismo, oculocutáneo tipo II 203200
[Piel / pelo / la pigmentación del ojo 1, rubia / morena de pelo] 227220
[Piel / pelo / ojos la pigmentación 1, de color azul / nonblue ojos] 227220

TEXTO
El gen OCA2 codifica una proteína que corresponde a la "dilución rosada de los ojos' (p) mutante del ratón. El producto del gen desempeña un papel en la regulación del pH de los melanosomas (Yuasa et al., 2007).


Clonación
Gardner et al. (1992) aislaron clones de cDNA de ratón a partir del locus p de melanoma de ratón y las bibliotecas de los melanocitos. El residuo deducirse 833-proteína tiene una masa molecular de 92 kD. Gardner et al. (1992) obtuvo el homólogo humano de la p murino cDNA por cribado una biblioteca de ADNc de melanoma humano con un fragmento de ADN genómico de ratón. La secuencia predicha de aminoácidos del producto del gen humano mostró 84% de identidad de aminoácidos 283 a 414 de la proteína de ratón predicho.

Rinchik et al. (1993) demostraron que la DN10 ADNc humano, ligado al locus p en ratones, identifica el homólogo humano (P) del gen de ratón p, y parece codificar una proteína de membrana integral transportador. La proteína humana P es un ácido polipéptido 838-amino que contiene 12 dominios transmembrana putativo y exhibe homología estructural a los transportadores de pequeñas moléculas orgánicas.

Lee et al. (1995) observó que la proteína P 838-residuo contiene 12 dominios transmembrana dispuestos de manera similar a los transportadores de diferentes y parece ser una proteína de membrana de los melanosomas. La comparación de secuencias sugirió a Lee et al. (1995) que la proteína P es un miembro de una familia de transportadores que incluye una E. coli Na + / H + antiporter y que puede ser un transportador de tirosina.


Estructura del Gen
 Lee et al. (1995) informó de que el gen OCA2 humano contiene 25 exones que se extienden entre 250 y 600 kb, el exón 1 es no codificante.


Mapeo
 Mediante electroforesis en gel de campo pulsado, Gardner et al. (1992) encontraron que las sondas derivadas del gen de ratón p mostraron patrones idénticos de hibridación a los observados con el humano D15S12 locus en el cromosoma 15q humanos, lo que sugiere que el 2 eran homólogos. El locus D15S12 había sido localizado en el cromosoma 15q11.2-q12 humana ( Donlon et al, 1986. ; Knoll et al, 1990. ; . Robinson et al, 1991 ), la región de anormalidad asociada con el síndrome de Prader-Willi (SPW; 176.270 ) y el síndrome de Angelman (AS, 105830 ).


Función del gen
 Utilizando el análisis de inmunotransferencia para examinar melanocitos murinos, Rosemblat et al. (1994) demostró que el gen codifica una p 110-kD hidrófobo proteína integral de membrana melanosomal. La proteína estaba ausente de los melanosomas cultivadas a partir de 2 cepas de ratones mutantes en los que la transcripción del gen de p no se expresó. Fraccionamiento subcelular de melanocitos cultivados demostraron que la proteína estaba presente en melanosomas, pero ausentes de la fracción rica en gránulo vesícula pequeña de melanocitos.


Genética Molecular
Lee et al. (1995) informó de varios polimorfismos en el gen P.

albinismo oculocutáneo tipo II
En un paciente con la tirosinasa positivo albinismo oculocutáneo u OCA2 (203.200 ), Rinchik et al. (1993) demostró la supresión de la poli (A) la cola y parte del último exón del gen OCA2, heredado de su madre, y la supresión de todo el lugar heredado de su padre. El paciente también tenía el síndrome de Prader-Willi. Los autores observaron que la prevalencia de la tipo II OCA entre los pacientes con síndrome de Prader-Willi y el síndrome de Angelman, tal vez un 1%, es consistente con la frecuencia esperada de los transportistas de tipo II OCA, dada la frecuencia de la enfermedad de aproximadamente 1 por 36.000 en de raza blanca.

 En los miembros afectados de una parentela consanguínea con el OCA2, Durham-Pierre et al. (1994) identificó un homocigoto de 2,7 kb que comprende la eliminación de un exón del gen P (611409.0001 ). La tribu era de África, el Cáucaso, y de ascendencia india americana. La supresión alelo misma fue identificada en relación afroamericanos, haitianos y africanos con OCA2, sugiriendo un efecto fundador.

Albinismo marrón oculocutáneo (véase 203200 ) también está relacionada con el lugar de P, y la presencia de tanto OCA2 y Boca dentro de la misma familia sugiere que estos trastornos son alélica. Manga (1997) encontró que una gran proporción (09.10) de los sujetos Boca fueron heterocigotos compuestos con la supresión de 2,7 kb del gen OCA2 en un alelo.

 Lee et al. (1994) identificaron mutaciones homocigotas o heterocigotas compuestas en el gen OCA2 (véase, por ejemplo, 611,409.0003 - 611,409.0006 ) en individuos con albinismo oculocutáneo. Lee et al. (1994) estudiaron 7 pacientes no relacionados con el OCA2 afroamericanos e identificado diferentes anomalías en el gen P en todas las 7.

Kawai et al. (2005) señaló que más de 50 mutaciones diferentes en el gen OCA2 se han reportado.

Rooryck et al. (2011) indicó que reordenamientos del gen OCA2 puede estar presente en aproximadamente el 20% de los pacientes OCA2, lo que indica que la alta resolución CGH-array análisis es importante para el diagnóstico adecuado molecular en pacientes candidatos.

Variación del Pigmento Normal
tecla A. et al. (2001) estudió la contribución de los P y MC1R ( 155.555 ) genes a la variación interindividual en la pigmentación de la piel en la población tibetana. Ellos genotipo 3 polimorfismos de nucleótido único (SNPs) en el gen MC1R y dos SNPs en el gen P en 184 sujetos al azar tibetanos comprobados, cuyo color de la piel se midió como un rasgo cuantitativo por espectroscopia reflectante. Single-locus análisis no demostraron una asociación entre cualquiera de los SNPs 5 y pigmentación de la piel. Sin embargo, cuando un modelo epistática se aplicó a los datos, una significativa interacción gen-gen fue identificado entre val92 a Met ( 155555.0002 ) en el gen MC1R y el polimorfismo IVS13-15T-C en el gen P identificada por Lee et al. (1995) .

Una vinculación de exploración genómica para el color de los ojos por Zhu et al. (2004) sugirió que el 74% de la variación en el color de los ojos de los europeos se puede atribuir a un QTL ligado a la región del OCA2 15q.

Duffy et al. (2007) llevó a cabo la genotipificación adicional para aclarar el papel de los OCA2 lugar en la herencia del color de ojos y otros rasgos pigmentarios asociados con el riesgo de cáncer de piel en la población blanca. La mayor asociación del color de ojos azul / nonblue ( 227.220 ) se encontró con 3 OCA2 SNPs en el intrón 1, rs7495174 (T / C), rs4778241 (G / T) y rs4778138 (T / C). Estos SNPs 3 se encuentran en un gran bloque de haplotipos ( 611409.0013 ), con el TGT que representa el 78,4% de los alelos. El impacto en la población menor de los polimorfismos de la región de codificación nonsynonymous arg305 a PRT ( 611409.0011 ) y arg419 a gln ( 611409.0012 ) asociado con los ojos nonblue ( Rebbeck et al, 2002. ; . Jannot et al, 2005 ) y la vinculación estrecha del haplotipo TGT importante dentro del intrón 1 de OCA2, con el color de ojos azules y pelo más claro y los tonos de la piel sugiere que las diferencias dentro de la 5-primera región reguladora proximal del gen OCA2 alterar la expresión o los niveles de mRNA de transcripción y pueden ser responsables de estas asociaciones.

Frudakis et al. (2007) desarrolló una escala de color del iris para cuantificar el contenido de melanina del iris ('C') in silico y analizó el locus OCA2 en 1.317 personas, lo que confirma 6 asociaciones descritas anteriormente y la identificación de otros 27 SNP fuertemente asociados con 'C' Con 4 juegos SNP discontinuos y no se superpongan a través de bloques de desequilibrio de ligamiento, los autores examinaron 82 muestras y se encontró que aquellos con diplotypes juego compuesto de SNPs que no se solapan OCA2 mostraron una tasa de 'C' concordancia de 96,3%, que fue significativamente mayor que la de azar muestras seleccionadas (62,6%, p inferior a 0,0001). Frudakis et al. (2007) llegó a la conclusión de que OCA2 es el principal gen humano el color del iris, y sugirió que mediante el uso de una base de datos empírica basada en el sistema, los genotipos de un pequeño número de SNPs en este gen puede ser utilizado para predecir con exactitud el contenido de melanina del iris a partir del ADN.

Melanoma
Jannot et col. (2005) genotipo 113 pacientes con melanoma maligno cutáneo (ver 155600 ) y 105 controles de los SNPs en el gen OCA2. Análisis de la distribución alélica mostró una asociación entre el melanoma y el OCA2 (p = 0,030), las pruebas revelaron que la combinación de una combinación formada por dos SNPs, 112 IVS13 y A776A ( rs1800419 ), estaba más fuertemente asociado con el melanoma (nominal p = 0,001). Jannot et al. (2005) llegó a la conclusión de que el genotipo OCA2 influye en el riesgo de melanoma.


Historia

El locus ojo rosa (o dilución ojos rosados) en el ratón es de gran importancia histórica debido a la vinculación de este lugar con un locus del albinismo por Haldane et al. (1915) fue el primer vínculo de mamíferos por descubrir. El gen posteriormente se demostró ser el cromosoma del ratón 7 y la naturaleza molecular de la mutación identificada ( Lyon et al, 1992. ; . Gardner et al, 1992 ).


Modelo Animal
La "rosa de ojos dilución" (p) del ratón se ha reducido la pigmentación del pelaje y ojos hereda como un rasgo autosómico recesivo. Gardner et al. (1992) encontró que la transcripción del gen murino p faltaba o alterado en 6 alelos mutantes independientes del locus p derivados de ratones hipopigmentadas, lo que sugiere que la alteración de este gen es responsable de la enfermedad. Los autores observaron que a pesar de hipopigmentación caracteriza tanto el síndrome de Prader-Willi y de Angelman, otras características de estos trastornos no se encuentran en el ratón p. Los ratones heterocigotos para alelos mutantes de p son totalmente pigmentado con independencia del origen parental del alelo mutante, lo que sugiere que el gen del ratón no se ve afectada por la impresión.

Gondo et al. (1993) estudiaron el ratón de ojos rosados ​​mutación inestable, p (ONU), que afecta el color del pelaje, que exhibe una de las frecuencias más altas reportadas de reversión de cualquier mutación de los mamíferos y está asociado con una duplicación del ADN genómico en el locus p. Ellos demostraron que el ADN de p (ONU) se distingue de ADN de tipo salvaje y la reversión de una cabeza a la cola duplicación en tándem de aproximadamente 70 kb. No se detectaron diferencias entre el ADN de tipo salvaje y revertidas. Así, la reversión en el fenotipo se acopló con una pérdida de una copia del segmento 70-kb duplicado. Se comentó que el ratón p locus tiene un homólogo humano en D15S12 y que la duplicación de este gen se producen en alrededor del 6% de Prader-Willi (pacientes con síndrome de Hamabe et al., 1991 ).

Hagiwara et al. (2000) caracteriza un alelo mutante inducido por la radiación del lugar del ratón p que fue asociada con la insuficiencia para crecer y el síndrome de la pigmentación disminuida. Ratones homocigotos mostraron retraso en el crecimiento y murió dentro de 2 semanas después del nacimiento. Ellos desarrollaron bloqueo auriculoventricular progresiva y significativos cambios ultraestructurales en las células musculares, tanto esqueléticas y cardíacas. Hagiwara et al. (2000) determina que la mutación se asoció con un cromosoma 7 inversión que tanto el gen alterado p y el gen Sox6 ( 607 257).

Protas et al. (2006) generó un mapa de ligamiento de genoma para permitir el análisis de rasgos cuantitativos de morfologías evolutivamente derivados de la mexicana tetra cueva, una especie que ha sido, en una serie de cuevas independientes, en varias ocasiones desarrollado características especiales adaptadas a un entorno ecológico único y bien estudiado. Se centraron en el rasgo del albinismo y descubrió que está relacionado con el gen OCA2 en 2 poblaciones de las cavernas. Encontraron diferentes deleciones en OCA2 en cada población, y, usando un ensayo basado en células, mostró que ambos causados ​​pérdida de la función de la proteína correspondiente. Por lo tanto, las 2 poblaciones de las cavernas evolucionado de forma independiente el albinismo, a través de similares eventos mutacionales.


Variantes alélicas (Ejemplos seleccionados):
Ver Tabla
0.0001 El albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II BROWN albinismo oculocutáneo, INCLUIDO
OCA2, 2.7 KB DEL, EX7DEL
En los miembros afectados de una parentela consanguínea con el OCA2 ( 203.200 ), Durham-Pierre et al. (1994) identificó un homocigoto de 2,7 kb que comprende la eliminación de un exón del gen P. La tribu era de África, el Cáucaso, y de ascendencia india americana. La supresión alelo misma fue identificada en relación afroamericanos, haitianos y africanos con OCA2, sugiriendo un efecto fundador.

Albinismo marrón oculocutáneo (véase 203200 ) también está relacionada con el lugar de P, y la presencia de tanto OCA2 y Boca dentro de la misma familia sugiere que estos trastornos son alélica. Manga (1997) encontró que una gran proporción (09.10) de los sujetos Boca fueron heterocigotos compuestos con la supresión de 2,7 kb del gen OCA2 en un alelo. Manga et al. (2001) demostraron que 10 personas con albinismo oculocutáneo café en el sur de África fueron heterocigotos para la deleción de 2,7 kb. No tuvieron éxito en la definición de la segunda mutación pero se presume que se trataba de una mutación leve, posiblemente en la región del promotor (disminuyendo la expresión), o en otras regiones del gen P que no la pantalla.

Mediante el análisis de un haplotipo 5-SNP del OCA2 gen en el 53 no relacionados Camerún OCA2 los pacientes homocigotos para la deleción de 2,7 kb y 48 controles emparejados étnicamente, Aquaron et al. (2007) estima que la mutación se originó 4.100 a 5.645 años atrás.


0.0002 Albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II
 OCA2, IVS17DS, G-T, +1
En una niña de 7 años de edad, de ascendencia del norte de Europa con una forma leve de los OCA2 ( 203.200 ), Lee et al. (1994) identificaron heterocigosidad compuesto por 2 mutaciones en el gen OCA2: una transversion G-a-T en el primer nucleótido de la unión de empalme donador de IVS17 gen, y A481T (611409.0003 ). La piel del paciente era justo, pero sin curtir con normalidad, y su cabello era de color marrón rojizo. Sus iris eran azules y mostró transiluminación, y el fondo de ojo parecía no pigmentadas, con hipoplasia de la mácula. Tenía nistagmus y miopía severa, con una agudeza visual corregida de 20/200. Sus padres no estaban relacionados y tenían una pigmentación normal, y no había antecedentes familiares de albinismo. Pelo de bulbo actividad tirosinasa fue normal.

0.0003 Albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II
OCA2, ALA481THR [ dbSNP: rs74653330 ]
En una niña con una forma leve de OCA2 ( 203.200 ), Lee et al. (1994) identificaron heterocigosidad compuesto por 2 sustituciones en el gen OCA2: un ala481-a-Thr (A481T) de cambio y una mutación del sitio de empalme ( 611.409,0002 .) Lee et al. (1994) estimó la frecuencia de la sustitución A481T a ser de 0,01 en condiciones normales de individuos caucásicos.

En un estudio de transfección celular, Sviderskaya et al. (1997) demostraron que el alelo thr481 tenía aproximadamente 70% función residual.

Suzuki et al. (2003) encontró que la frecuencia del alelo thr481 fue de 0,12 en individuos japoneses que normalmente pigmentadas. Dos individuos que son homocigotos estaban completamente normal con respecto a la pigmentación de los ojos, la piel y el cabello. Los hallazgos sugieren que los resultados thr481 sólo en el fenotipo OCA2 cuando se combina con un nulo o alelo mutante OCA2 casi nula.

Yuasa et al. (2007) declaró que los resultados de una sustitución A481T 1559G-Una transición en el exón 14 del gen OCA2. Entre los más de 2.615 individuos sanos de 20 poblaciones africanas y euroasiáticas, Yuasa et al. (2007) encontró que el alelo thr481 prevaleció casi exclusivamente en una parte del noreste de Asia. La frecuencia de los alelos fue más alta en Buriatia (0,24) en Mongolia y mostró un gradiente norte-sur. Los resultados sugirieron que thr481 alelo surgió en una región de la radiación ultravioleta de baja y, posteriormente, se extendió a las poblaciones vecinas.


0.0004 Albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II
OCA2, VAL443ILE [ dbSNP: rs121918166 ]
En un niño de 4 años de edad, de ascendencia del norte de Europa con el típico tipo II albinismo oculocutáneo ( 203.200 ), Lee et al. (1994) identificó heterocigosis compuesta por 2 mutaciones en el gen OCA2: una G a una transición, lo que resulta en un cambio val443 a ile (V443I) heredado de la madre, y una transición C a T en el exón 22 dando como resultado un pro743 a leu (P743L; 611409.0005 ) la sustitución heredado del padre. La piel del paciente era muy ligeramente pigmentado, sin aparente capacidad de bronceado, y su cabello era de color amarillo dorado pálido. Sus iris eran azules y mostró transiluminación, y el fondo de ojo parecía no pigmentadas, con hipoplasia de la mácula. Su agudeza visual corregida fue 20/100, y tenía nistagmus y estrabismo. El análisis cromosómico demostró mosaicismo del 46, XY y 46, XY, dup (15) (q12). La duplicación, lo que ocurrió en el 25% de los estimulados leucocitos de sangre periférica, se interpretó como una variante nonpathologic cromosómica ( Ludowese et al., 1991 ).

Lee et al. (1994) encontró la misma sustitución de V443I en el cromosoma 15 de origen materno de un niño de 7 años de edad, con el típico tipo II albinismo oculocutáneo y el síndrome de Prader-Willi, siendo este último debido a la eliminación de 15q11.2-q13.1 derivado de el padre. El gen OCA2 paterna se ha eliminado en este niño.


0.0005 Albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II
OCA2, PRO743LEU [ dbSNP: rs121918167 ]
Ver 611409.0004 y Lee et al. (1994) .

0.0006 Albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II
OCA2, 1-BP DEL
En una niña paquistaní de 8 años de edad, con graves de tipo II albinismo oculocutáneo ( 203.200 ), Lee et al. (1994) identificaron un homocigotos 1-pb supresión de la primera base en el codón 654 del gen OCA2, resultando en un marco de lectura y la terminación prematura de la proteína en el codón 662. El paciente era un miembro de una tribu grande y altamente endogámica. Su piel era casi blanco, sin aparente capacidad de bronceado, y su cabello era de color amarillo dorado pálido. Sus iris eran de color azul pálido y mostraba transiluminación, y el fondo de ojo parecía no pigmentadas con hipoplasia máculas.

0.0007 Albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II
OCA2, ALA334VAL [ dbSNP: rs121918168 ]
En un estudio del sur de los negros africanos que tenían al menos un alelo del gen OCA2 que no era el común de eliminación de 2,7 kb ( 611409.0001 ), Kerr et al. (2000) encontraron 4 mutaciones en el gen OCA2, 1 de ellos era un ala334 a val (A334V) sustitución en el segundo dominio transmembrana de la proteína OCA2.

0.0008 Albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II
OCA2, 122.5 KB DEL
Yi et al. (2003) encontró una línea mediada por 122,5 kb deleción del gen OCA2 como la causa de frecuentes OCA2 ( 203.200 ) entre los Navajo en el noreste de Arizona. La supresión elimina los exones 10 a 20. Aunque no perturbar el marco de lectura del gen, que se elimine 345 del total de 838 aminoácidos. Los 12 dominios transmembrana de la proteína de tipo salvaje se redujeron a 5. Análisis de la secuencia de los puntos de interrupción y las secuencias que flanquean mostraron que ambos puntos de corte fueron exactamente finales se unió y ambos se encontraron dentro de mucho tiempo intercalados elementos de nucleótidos (líneas). Sin embargo, las líneas de puntos de corte fueron orientación opuesta, y no hay homología de secuencia entre ellos se encuentran en la coyuntura punto de interrupción.

0.0009 Albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II
OCA2, TRP679CYS [ dbSNP: rs121918169 ]
En un paciente con OCA2 ( 203.200 ), King et al. (2003) encontró heterocigosis compuesta por 2 mutaciones en el gen OCA2: trp679 a cys (W679C) en el alelo materno y asn489 a ASP (N489D; 611409.0010 ) en el alelo paterno. Este paciente representa un fenotipo de la pigmentación inusual que implicó rojo en lugar de pelo amarillo. De hecho, King et al. (2003) encontró una mutación en el gen MC1R ( 155555.0004 ) que será responsable para el cabello de color rojo en este paciente y en otros 5 con OCA2 que permanecieron con el pelo rojo después de su nacimiento.

0.0010 Albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II
OCA2, ASN489ASP [ dbSNP: rs121918170 ]
Ver King et al. (2003) y 611409.0009 .

0,0011 piel / pelo / PIGMENTACION OCULAR 1, Azul / NO-AZUL
OJOS Piel / pelo / PIGMENTACIÓN OCULAR 1,
OJOS AZULES / MARRÓN, INCLUIDO
OCA2, ARG305TRP [ dbSNP: rs1800401 ]
Utilizando una muestra de 629 personas que normalmente pigmentadas, Rebbeck et al. (2002) encontraron que los individuos portadores de las variantes arg305 OCA2-a-Trp (R305W) o arg419 a gln (R419Q) ( 611409.0012 ) o ambas cosas eran más propensos a tener los ojos nonblue (véase 227220 ) (p = 0,002, 0,001, y 0,003, respectivamente). La variante R305W se asoció con los ojos marrones. Estos resultados sugieren que el gen OCA2 puede, en parte, determinar la variación normal fenotípica en color del ojo humano y por lo tanto puede representar un biomarcador del riesgo de cáncer hereditario cutánea.

Jannot et al. (2005) replica a la asociación de la variante R305W en el OCA2, con el color de ojos nonblue en una población francesa.

0,0012 piel / pelo / PIGMENTACION OCULAR 1, Azul / NO-AZUL OJOS
OCA2, ARG419GLN
Ver 611409.0011 y Rebbeck et al. (2002) . Rebbeck et al. (2002) descubrieron que la variante R419Q se asoció con los ojos verdes / avellana (véase 227220 ).

Jannot et al. (2005) fueron incapaces de replicar la asociación de la variante R419Q de los OCA2, con el color de ojos nonblue en una población francesa.

Sturm et al. (2008) demostró que el OCA2 codificación SNP R419Q ( rs1800407 ) actúa como un modificador de la penetrancia de HERC2 rs12913832 ( 605837.0003 ).


0,0013 piel / pelo / OJO PIGMENTACION 1, Azul / NONBLUE OJOS Piel / pelo / OJO PIGMENTACIÓN 1, OJOS AZULES / BROWN, INCLUIDO
piel / pelo / la pigmentación del ojo 1, Rubio / Castaño PELO, INCLUIDO
OCA2, IVS1, haplotipo 1 [ dbSNP: rs4778138 ] [ dbSNP: rs4778241 ] [ dbSNP: rs7495174 ]
Para aclarar el papel de los OCA2 lugar en la herencia del color de ojos y otros rasgos pigmentarios asociados con el riesgo de cáncer de piel en las poblaciones blancas, Duffy et al. (2007) genotipo 3.839 gemelos adolescentes, hermanos y padres de familia el 58 exonic SNPs sinónimos y no sinónimos y SNPs de marcado en el locus OCA2. Los autores encontraron que la mayor asociación del color de ojos azul / nonblue ( 227.220 ) fue encontrado con tres SNPs OCA2 en el intrón 1: rs7495174 , T / C, rs4778241 (anteriormente rs6497268), G / T, y rs4778138 (antes 11855019), T / C. Estos SNPs 3 se encuentran en un bloque de haplotipos importante, con TGT que representa el 78,4% de los alelos. El diplotipo TGT / TGT encuentra en 62,2% de las muestras fue el genotipo importante visto para modificar el color de ojos, con una frecuencia de 0,905 en azul o verde en comparación con sólo 0,095 en el color de ojos marrón. Este genotipo también estaba en la frecuencia más alta en los sujetos con el pelo castaño claro y era más frecuente en los tipos de piel justo y medianas empresas, de conformidad con el haplotipo TGT actúa como un modificador de la recesiva más ligeros fenotipos pigmentación. Los homocigotos para rs4778138 C / C eran en su mayoría, sin pecas y tenían recuentos más bajos de topo. En un estudio de asociación de las variantes de la pigmentación usando muestras de la población islandesa y holandesa, Sulem et al. (2007) encontró asociación de la rs7495174 , rs4778241 y rs4778138 identificado por Duffy et al. (2007) con el color de los ojos azules y pelo rubio. El alelo A de rs7495174 se asoció fuertemente con los ojos azules frente al café (OR = 6,90, p = 3,0 x 10 (-24)).


0.0014 El albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II OCA2, MET394ILE [ dbSNP: rs121918171 ]
En un hombre japonés de 21 años de edad, con subclínica OCA2 ( 203.200 ), Kawai et al. (2005) identificó heterocigosis compuesta por 2 mutaciones en el gen OCA2: una G a una transición, lo que resulta en un met394 a ile (M394I), y la sustitución A481T ( 611409.0003 ). El hombre se presentó con una quemadura de sol ampollas en los brazos de la espalda y parte superior después de bañarse en el mar durante aproximadamente 1 hora. Tenía una quemadura superficial cutánea más del 18% de la superficie del cuerpo y fue ingresado en el hospital para recibir tratamiento. Él aparece con la piel pálida, pero el pelo castaño oscuro y la iris. Kawai et al. (2005) señaló que este paciente tenía una forma subclínica de OCA2 con la piel pálida y poca resistencia a la tensión de las quemaduras solares.
0.0015 El albinismo, OCULOCUTÁNEO, TIPO II OCA2, 184 KB DEL
En 3 pacientes no relacionados con los de ascendencia polaca OCA2 ( 203.200 ), Rooryck et al. (2011) identificaron una deleción 184-kB en el gen OCA2 (25,793,533-25,977,380, NCBI36.1) que abarca los exones 3 a 20. Uno de los pacientes era homocigoto para la eliminación, y el otro era heterocigoto para la eliminación y otra mutación patogénica OCA2. Una segunda mutación no pudieron ser identificados en el tercer paciente. El análisis de haplotipos se indica un efecto fundador. El análisis de secuencia mostró que los 2 puntos de interrupción se encuentra en regiones de repetición-ricos que contienen aluminio y repite numerosas L1, lo que sugiere no homóloga terminar unirse como el mecanismo molecular.
Ver también: Brillante (1992) ; Spritz et al. (1995) ; Stevens et al. (1997) ; Stevens et al. (1995) , Suzuki et al. (2003) ; Waardenburg (1961)
Referencias


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Cassandra Kniffin L. - Actualizado: 04/26/2011
Fecha de creación: Cassandra Kniffin L.: 09/04/2007
Terry: 06/02/2011